El Institut Pasteur de Montevideo, inaugurado en diciembre de 2006, surge como fruto de un convenio entre la Universidad de la República, el Estado Uruguayo y el Institut Pasteur Paris (Francia). Se convirtió así en uno de los 33 Institutos miembros de la Red Internacional de Institutos Pasteur. El Institut Pasteur Montevideo fue concebido como una fundación privada sin fines de lucro, un centro de investigación uruguayo capaz de adaptarse a los progresos continuos de la ciencia y la tecnología.

Tiene como misión ser un centro de excelencia en investigación científica, y contribuir al desarrollo del país mediante la transferencia tecnológica al sector productivo, respondiendo a necesidades de nuestra sociedad. La instalación de Infraestructura de Investigación con plataformas tecnológicas de punta abiertas a usuarios científicos del país y la región, fue un eje de desarrollo central desde su inicio, junto al impulso de la investigación científica de excelencia y el entrenamiento a través de cursos avanzados.